Le pilotage est l’une des activités à forte valeur ajoutée du PAD certifié ISO 9001.  

Les performances réalisées lui ont valu depuis  2009  le renouvellement régulier de cette certification pour le service "Pilotage Entrée, Sortie et Déhalage des navires de commerce pilotables".

Au PAD, tout navire supérieur à 1500 m3 doit être piloté obligatoirement.

Quinze (15) pilotes capitaines au long cours, une flotte de six (6) pilotines et sept (7) pc d’amarrage assurent sans interruption, à tour de rôle, les manœuvres d’assistance des navires à l’entrée et à la sortie.

Plusieurs vedettes de servitude sont affectées au transport passager (délégations et personnalités), aux nécessités du service, aux rondes de sécurisation. Au sea-line de Mbao, les opérations de connexions et de déconnexions sont faites à l’aide d’une vedette de servitude avec un équipage du service Armement et de la Société Africaine de Raffinage (SAR).